Андрей Владимирович Якунин родился 5 апреля 1975 года в Ленинграде. Окончил Санкт-Петербургский государственный университет, защитил кандидатскую диссертацию в области финансов и кредита в СПбГУ. Имеет степень EMBA Global по международной программе бизнес-школ London Business School и Columbia University GSB.
Старший сын Владимира Якунина, экс-главы РЖД.
Работал в гостиничном комплексе «Прибалтийская» в Санкт-Петербурге. Один из основателей и партнеров британской инвестиционной компании Venture Investments & Yield Management (VIYM), занимающейся девелоперскими проектами в Санкт-Петербурге. Среди проектов компании — реконструкция в Петербурге Никольских рядов и знаменитого Дома со львами.
Одним из первых опытов инвестиций для VIYM стала сделка объемом около $10 млн с петербургским сельскохозяйственным холдингом Виктора Козырева: его компании предоставили средства на строительство комплекса по переработке и фасовке круп в Краснодарском крае. При выходе из проекта в 2015 году, рассказывал Forbes сам Якунин, инвестиции удвоились. Фонд VIYM Growth Fund инвестировал в десяток российских компаний. Среди них, например, медклиника «Семейный доктор» и производитель бумажных изделий «Сыктывкар Тиссью Груп»
В 2006 году Якунин и партнеры продали «Прибалтийскую» норвежской компании Wenaas Holding, по оценкам, за $100 млн.
В 2009 году принадлежащая Андрею Якунину Региональная гостиничная сеть (РГС) подписала с компанией The Rezidor Hotel Group стратегическое соглашение об открытии 20 отелей под брендом Park Inn by Radisson в крупных городах России. В 2016 году АФК «Система» купила РГС за 6,6 млрд рублей, притом что долг компании на тот момент составлял 4 млрд рублей.
В 2014 году предприниматель купил блокирующий пакет ООО «Френчкисс» (сеть шоколадных бутиков French Kiss).
Помимо этого, Андрей Якунин выступает одним из учредителей фонда «Петербург Достоевского». К 2017 году под управлением команды Андрея Якунина оказались активы на $1 млрд. Это недвижимость и прямые инвестиции (включая долговое финансирование). Только его гостиничный фонд VIYM Greater Europe Hospitality Fund инвестировал в итальянский премиум-проект Antognolla Luxury Resort and Residences — реконструкцию средневекового имения в Умбрии (инвестиции составят €150 млн), а также в австрийскую четырехзвездочную гостиницу Park Royal Palace Hotel.
17 октября 2022 года Андрея Якунина задержали по обвинению в нарушении закона о санкциях, который запрещает россиянам использовать беспилотники на территории Норвегии. Первоначально его оправдали, однако в 2023 году Верховный суд отменил оправдательный приговор и вернул дело на новое рассмотрение. В апреле 2024 года Норвежский суд вновь встал на сторону предпринимателя. В суде Якунин попросил считать его гражданином Великобритании, а местом своего постоянного проживания назвал Италию.
Открыто владеет или владел: ООО «Визит», ООО «Фирма Парус», ООО «Петербург Достоевского», АО «Фонд Тристар Инвестмент Холдингс», ООО «Уютный Дом», ООО «Центр И.К.О.», ООО «Ассоциация Аркада-Инвест», ЗАО «Пролог-Проект».